PlotTracks

Example command

$ TOBIAS PlotTracks --bigwigs test_data/*cell_corrected.bw --bigwigs test_data/*cell_footprints.bw --regions test_data/plot_regions.bed --sites test_data/binding_sites.bed --highlight test_data/binding_sites.bed --gtf test_data/genes.gtf --colors red darkblue red darkblue

~10 seconds

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Example output