La epigenética es el estudio de los cambios fenotípicos heredables que no involucran un cambio de nucleótidos en la secuencia de ADN. La metilación del ADN y la modificación de histonas son algunos de los mecanismos más estudiados involucrados en epigenética. En plantas modelos y cultivos, los cambios epigenéticos han sido asociados con cambios de expresión génica (Lang et al., 2017), interacciones entre chromosomas (Feng et al., 2014), y estabilidad genómica (Tsukahara et al., 2009), entre otras.
La teoría del curso presenta los fundamentos de la epigenética en plantas y su rol en la evolución. Mientras que la práctica ofrece una visión en profundidad del análisis de datos de secuenciación de nueva generación y la identificación cuantitativa de cambios de metilación.
| Módulo | Tema | Presentación | Video |
|---|---|---|---|
| 1 | Historia y definición. La epigenética como disciplina científica | Link | Link |
| 2A | Biogénesis y función de pequeños ARNs | Link | Link |
| 2B | Metilación del ADN | Link | Link |
| 2C | Modificación postraduccional de histonas | Link | Link |
| 2D | Técnicas moleculares para el estudio de los mecanismos epigenéticos en plantas | Link | Link |
| 3A | Imprinting en vegetales | Link | Link |
| 3B | Desarrollo en vegetales: vernalización y paramutación | Link | Link |
| 4A | Modulación de mecanismos epigenéticos por el ambiente | Link | Link |
| 4B | Modulación de mecanismos epigenéticos por factores bióticos | Link | Link |
| 4C | Estrés genómico/Remodelación del genoma | Link | Link |
| 5A | Epialelos naturales | Link | Link |
| 5B | Hibridización interespecífica y poliploidía | Link | Link |
| 5C | Distribución de la variabilidad epigenética en poblaciones naturales vegetales | Link | - |
| 5D | Mejoramiento epigenético | Link | Link |
| - | Phytochrome-mediated light perception affects fruit development and ripening through epigenetic mechanisms (Dra. Luisa F. Bermudez Salazar) | - | Link |
| TP | Tema | Cuaderno | Video |
|---|---|---|---|
| 0 | Introducción a Colab | Link | Link |
| 1 | Marcadores MSAP | Link | Link |
| 2 | Procesamiento de datos RRBS | Link | Link |
| 3 | Análisis de datos RRBS | Link | Link |
| 4 | Procesamiento de datos epiGBS | Link | Link |
| 5 | Análisis de datos de pequeños ARNs (small RNA) | Link | Link |
Dudas sobre los contenidos del curso pueden ser dirigidas a la siguiente lista de correo.
- Dra. Verónica Noé Ibáñez, IBAM-CONICET/UNCuyo, Mendoza | email: veronicanoeibanez@gmail.com
- Dr. Carlos Marfil, FCA-UNCuyo | INTA EEA-Mendoza, Mendoza | email: cmarfil@fca.uncu.edu.ar
- Dr. Ricardo Masuelli, FCA-UNCuyo | IBAM-CONICET/UNCuyo, Mendoza | email: rmasuelli@gmail.com
- Dr. Nicolás Cara, FCA-UNCuyo | IBAM-CONICET/UNCuyo, Mendoza | email: ncara@fca.uncu.edu.ar
- Dr. Alejandro Edera, sinc(i)-CONICET/UNL, Santa Fe | email: aedera@sinc.unl.edu.ar
- Dr. Sebastian Asurmendi, IABIMO-CONICET/INTA, Buenos Aires | email: asurmendi.sebastian@inta.gob.ar
- Dr. Diego Zavallo, IABIMO-CONICET/INTA, Buenos Aires | email: zavallo.diego@inta.gob.ar